2023年度のワースト1は、久留里線でしたが、今回は6位に大きく改善し、営業係数がもっとも悪い線区は、陸羽東線の鳴子温泉駅～最上駅間となりました。陸羽東線（鳴子温泉駅〜最上駅、最上駅〜新庄駅）は、2024年7月の豪雨による被災にともない2024年8月〜バス代行輸送を実施したため、その影響です。
吾妻線（長野原草津口駅～大前駅）は廃止の方針
近年の集中豪雨は、鉄道の維持にとっては死活問題で、JR東日本管内でも津軽線、奥羽本線、陸羽東線、陸羽西線で不通区間（バス代行輸送）が生まれています。
そのために営業係数のランキングにも大きな変動がみられました。
関東では、久留里線（久留里駅〜上総亀山駅）の営業係数が、2023年度の1万3580から6694に大幅に改善しています。
吾妻線（長野原草津口駅～大前駅）は、昨年20位で2870だった営業係数が12位の4790に大幅に悪化しています。
JR東日本は、吾妻線長野原草津口～大前間廃止に向け、2025年9月～12月、代替バスの実証運行を実施。
しかも並走する道路ではなく、北陸新幹線軽井沢駅が起点のバスとなっています。
大前から高崎に通う高校生は、軽井沢にバスで出て新幹線通学をということに。
JR東日本 営業係数ワースト20｜2025
| 順位 | 線名 | 区間 | 営業キロ | 営業係数 （2023年度） | 民営化時との比較 |
| 1位 | 陸羽東線 | 鳴子温泉駅～最上駅 | 20.7km | 2万2360 | △93% |
| 2位 | 津軽線 | 中小国駅～三厩駅 | 24.4km | 1万649 | △86% |
| 3位 | 飯山線 | 戸狩野沢温泉駅〜津南駅 | 30.4km | 1万460 | △89% |
| 4位 | 花輪線 | 荒屋新町駅〜鹿角花輪駅 | 32.1km | 1万80 | △93% |
| 5位 | 磐越西線 | 野沢駅〜津川駅 | 30.8km | 7505 | △90% |
| 6位 | 久留里線 | 久留里駅〜上総亀山駅 | 9.6km | 6694 | △91% |
| 7位 | 只見線 | 只見駅〜小出駅 | 46.8km | 6741 | △77% |
| 8位 | 山田線 | 上米内駅〜宮古駅 | 92.2km | 5437 | △89% |
| 9位 | 奥羽本線 | 新庄駅〜湯沢駅 | 61.8km | 5399 | △95% |
| 10位 | 陸羽西線 | 新庄駅〜余目駅 | 43.0km | 5356 | △95% |
| 11位 | 水郡線 | 常陸大子駅～磐城塙駅 | 25.7km | 5222 | △80% |
| 12位 | 吾妻線 | 長野原草津口駅～大前駅 | 13.3km | 4790 | △65% |
| 13位 | 米坂線 | 今泉駅～小国駅 | 35.3km | 4312 | △84% |
| 14位 | 陸羽東線 | 最上駅～新庄駅 | 28.5km | 4220 | △87% |
| 15位 | 米坂線 | 小国駅～坂町駅 | 32.4km | 4106 | △90% |
| 16位 | 北上線 | ほっとゆだ駅〜横手駅 | 25.9km | 3847 | △86% |
| 17位 | 只見線 | 会津坂下駅〜会津川口駅 | 39.2km | 3803 | △70% |
| 18位 | 津軽線 | 青森駅～中小国駅 | 31.4km | 3449 | △96% |
| 19位 | 気仙沼線 | 前谷地駅～柳津駅 | 17.5km | 3416 | △86% |
| 20位 | 米坂線 | 今泉駅〜小国駅 | 35.3km | 3404 | △82% |
| 次点 | 五能線 | 能代駅〜深浦駅 | 63.0km | 3369 | △66% |
■津軽線（中小国駅～三厩駅）、米坂線（今泉駅～小国駅、小国駅～坂町駅）は、2022年8月の豪雨による被災以降、バス等による代行輸送を実施
■奥羽本線（新庄駅〜湯沢駅）は、2024年7月の豪雨による被災にともない2024年8月〜2025年4月の間、バス代行輸送を実施
■陸羽東線（鳴子温泉駅〜最上駅、最上駅〜新庄駅）は、2024年7月の豪雨による被災にともない2024年8月〜バス代行輸送を実施
■陸羽西線（新庄駅〜余目駅）は、国道47号高屋道路のトンネル工事のため2022年5月からバス代行輸送を実施
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